Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PsenenQ9CQR7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PsenenQ9CQR7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms