Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubl4bQ9CQ84 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms