Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms