Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms