Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms