Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdac9Q99N13 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms