Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaipQ99ME3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms