Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lysmd3Q99LE3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms