Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pagr1aQ99L02 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms