Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms