Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms