Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcoln1Q99J21 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms