Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Rnf144aQ925F3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf144aQ925F3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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