Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim7Q923T7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim7Q923T7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim7Q923T7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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