Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csmd1Q923L3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csmd1Q923L3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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