Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim59Q922Y2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms