Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usb1Q91W78 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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