Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zkscan3Q91VW9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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