Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmcd1Q8VEE1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms