Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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