Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmx1Q8VBT0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms