Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms