Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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