Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms