Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Phf13Q8K2W6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Phf13Q8K2W6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Phf13Q8K2W6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Phf13Q8K2W6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Phf13Q8K2W6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms