Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms