Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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