Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs1Q8K212 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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