Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms