Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgbQ8K0E8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms