Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim61Q8JZK6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms