Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms