Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc43a2Q8CGA3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms