Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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