Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp27Q8CEG8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp27Q8CEG8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms