Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms