Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc9Q8CDN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms