Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms