Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms