Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lrif1Q8CDD9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lrif1Q8CDD9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lrif1Q8CDD9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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