Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc27Q8CD92 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc27Q8CD92 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc27Q8CD92 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc27Q8CD92 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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