Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CC96 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CC96 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms