Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nlrp4bQ8C6J9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nlrp4bQ8C6J9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nlrp4bQ8C6J9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nlrp4bQ8C6J9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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