Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933409G03RikQ8C5U0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms