Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms