Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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