Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc22Q8C159 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc22Q8C159 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc22Q8C159 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc22Q8C159 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc22Q8C159 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc22Q8C159 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ttc22Q8C159 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc22Q8C159 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc22Q8C159 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc22Q8C159 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc22Q8C159 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc22Q8C159 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc22Q8C159 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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