Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trub1Q8C0D0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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