Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Snx16Q8C080 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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