Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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